Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc47Q505F5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc47Q505F5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc47Q505F5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc47Q505F5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc47Q505F5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc47Q505F5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc47Q505F5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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