Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3lQ4KL14 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms