Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shank3Q4ACU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shank3Q4ACU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shank3Q4ACU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms