Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ulk4Q3V129 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms