Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr7Q3V0I2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms