Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Garnl3Q3V0G7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms