Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933416C03RikQ3V063 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933416C03RikQ3V063 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms