Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc27Q3V036 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms