Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrfip1Q3UZ39 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms