Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms