Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb2Q3UUV9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb2Q3UUV9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb2Q3UUV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb2Q3UUV9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb2Q3UUV9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms