Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim15Q3UTD9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim15Q3UTD9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms