Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BB287469Q3UT53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms