Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhdc9Q3USL1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms