Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms