Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsf3Q3URE1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms