Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwa5b2Q3UR50 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms