Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp953Q3UPV7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp953Q3UPV7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms