Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrch2Q3UMG5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms