Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cobll1Q3UMF0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms