Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc4Q3UMB9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Washc4Q3UMB9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Washc4Q3UMB9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms