Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc61Q3UJV1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms