Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitpnm3Q3UHE1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms