Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc10a4Q3UEZ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc10a4Q3UEZ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms