Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U595 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U595 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U595 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U595 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U595 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U595 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U595 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms