Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssbp4Q3U4B1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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