Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam117bQ3U3E2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam117bQ3U3E2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms