Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms