Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TraddQ3U0V2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TraddQ3U0V2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms