Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms