Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd6Q3TY92 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd6Q3TY92 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms