Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc136Q3TVA9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc136Q3TVA9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc136Q3TVA9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms