Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccbe1Q3MI99 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccbe1Q3MI99 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms