Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna5Q2MKA5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms