Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam178bQ24JP3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam178bQ24JP3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam178bQ24JP3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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