Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Shroom4Q1W617 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
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Shroom4Q1W617 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
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Shroom4Q1W617 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Shroom4Q1W617 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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