Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cers3Q1A3B0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cers3Q1A3B0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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