Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tdrd9Q14BI7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd9Q14BI7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tdrd9Q14BI7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms