Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab42Q0PD08 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms