Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TrioQ0KL02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TrioQ0KL02 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms