Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc21bQ0HA38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttc21bQ0HA38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttc21bQ0HA38 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms