Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf541Q0GGX2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms