Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CbfbQ08024 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CbfbQ08024 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms