Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MestQ07646 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MestQ07646 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MestQ07646 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MestQ07646 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MestQ07646 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MestQ07646 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms