Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CluQ06890 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CluQ06890 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CluQ06890 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CluQ06890 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CluQ06890 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CluQ06890 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CluQ06890 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CluQ06890 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CluQ06890 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms