Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms