Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPINDOCQ05AH6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPINDOCQ05AH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPINDOCQ05AH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms