Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a1Q05722 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms