Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcad1Q04692 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms