Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nf1Q04690 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms